Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6K3

PTAR1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAR1Q7Z6K3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTAR1Q7Z6K3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTAR1Q7Z6K3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTAR1Q7Z6K3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTAR1Q7Z6K3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTAR1Q7Z6K3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTAR1Q7Z6K3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms