Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX20Q7Z614 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX20Q7Z614 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms