Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D4Q7Z3S7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CACNA2D4Q7Z3S7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNA2D4Q7Z3S7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms