Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC46A3Q7Z3Q1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms