Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMIM15Q7Z3B0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM15Q7Z3B0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM15Q7Z3B0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms