Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYS1Q717R9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYS1Q717R9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms