Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
FGD6Q6ZV73 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
FGD6Q6ZV73 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
FGD6Q6ZV73 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
FGD6Q6ZV73 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
FGD6Q6ZV73 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
FGD6Q6ZV73 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
FGD6Q6ZV73 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
FGD6Q6ZV73 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
FGD6Q6ZV73 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
FGD6Q6ZV73 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
FGD6Q6ZV73 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
FGD6Q6ZV73 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
FGD6Q6ZV73 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
FGD6Q6ZV73 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
FGD6Q6ZV73 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
FGD6Q6ZV73 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
FGD6Q6ZV73 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
FGD6Q6ZV73 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FGD6Q6ZV73 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
FGD6Q6ZV73 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
FGD6Q6ZV73 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
FGD6Q6ZV73 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
FGD6Q6ZV73 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
FGD6Q6ZV73 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
FGD6Q6ZV73 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
FGD6Q6ZV73 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
FGD6Q6ZV73 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.87■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
FGD6Q6ZV73 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.78■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
FGD6Q6ZV73 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
FGD6Q6ZV73 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1842.2 ms