Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHISA6Q6ZSJ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SHISA6Q6ZSJ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHISA6Q6ZSJ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms