Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAP2EQ6VUC0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAP2EQ6VUC0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TFAP2EQ6VUC0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAP2EQ6VUC0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms