Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP26C1Q6V0L0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP26C1Q6V0L0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP26C1Q6V0L0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms