Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG3Q6UXM1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIG3Q6UXM1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms