Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCBE1Q6UXH8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCBE1Q6UXH8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms