Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD1Q6UWL2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD1Q6UWL2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms