Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CASC4Q6P4E1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms