Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NANOGP8Q6NSW7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NANOGP8Q6NSW7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGP8Q6NSW7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGP8Q6NSW7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms