Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPN13Q6MZZ7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN13Q6MZZ7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN13Q6MZZ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms