Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CARMIL2Q6F5E8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CARMIL2Q6F5E8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CARMIL2Q6F5E8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
CARMIL2Q6F5E8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CARMIL2Q6F5E8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CARMIL2Q6F5E8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
CARMIL2Q6F5E8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CARMIL2Q6F5E8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CARMIL2Q6F5E8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CARMIL2Q6F5E8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CARMIL2Q6F5E8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CARMIL2Q6F5E8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC40.05■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.04■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC40.04■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
CARMIL2Q6F5E8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC40■■■■□ 3.99
CARMIL2Q6F5E8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CARMIL2Q6F5E8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CARMIL2Q6F5E8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CARMIL2Q6F5E8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CARMIL2Q6F5E8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CARMIL2Q6F5E8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CARMIL2Q6F5E8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CARMIL2Q6F5E8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CARMIL2Q6F5E8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CARMIL2Q6F5E8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CARMIL2Q6F5E8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CARMIL2Q6F5E8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CARMIL2Q6F5E8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CARMIL2Q6F5E8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
CARMIL2Q6F5E8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
CARMIL2Q6F5E8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms