Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REP15Q6BDI9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
REP15Q6BDI9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
REP15Q6BDI9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REP15Q6BDI9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms