Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCTD16Q68DU8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCTD16Q68DU8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCTD16Q68DU8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCTD16Q68DU8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCTD16Q68DU8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCTD16Q68DU8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCTD16Q68DU8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCTD16Q68DU8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCTD16Q68DU8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCTD16Q68DU8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCTD16Q68DU8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCTD16Q68DU8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCTD16Q68DU8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCTD16Q68DU8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCTD16Q68DU8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD16Q68DU8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD16Q68DU8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD16Q68DU8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD16Q68DU8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD16Q68DU8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD16Q68DU8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms