Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
ECM29Q5VYK3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ECM29Q5VYK3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ECM29Q5VYK3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ECM29Q5VYK3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms