Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CHIC1Q5VXU3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CHIC1Q5VXU3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CHIC1Q5VXU3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CHIC1Q5VXU3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CHIC1Q5VXU3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CHIC1Q5VXU3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CHIC1Q5VXU3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
CHIC1Q5VXU3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
CHIC1Q5VXU3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CHIC1Q5VXU3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC41.94■■■■■ 4.31
CHIC1Q5VXU3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms