Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEPDC1Q5TB30 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DEPDC1Q5TB30 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms