Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM78Q5T7P6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM78Q5T7P6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM78Q5T7P6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms