Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBAP2Q5T6F2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBAP2Q5T6F2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBAP2Q5T6F2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBAP2Q5T6F2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms