Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWX8

ODR4, Protein odr-4 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODR4Q5SWX8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ODR4Q5SWX8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ODR4Q5SWX8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ODR4Q5SWX8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ODR4Q5SWX8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ODR4Q5SWX8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ODR4Q5SWX8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ODR4Q5SWX8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ODR4Q5SWX8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms