Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHYHD1Q5SRE7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHYHD1Q5SRE7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHYHD1Q5SRE7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms