Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM201Q5SNT2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM201Q5SNT2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM201Q5SNT2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM201Q5SNT2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms