Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSL3PQ5NE16 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTSL3PQ5NE16 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSL3PQ5NE16 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSL3PQ5NE16 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms