Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FBXO47Q5MNV8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXO47Q5MNV8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXO47Q5MNV8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO47Q5MNV8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms