Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
XKR4Q5GH76 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
XKR4Q5GH76 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XKR4Q5GH76 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms