Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD39Q53RE8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD39Q53RE8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms