Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIPR1Q53HC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIPR1Q53HC9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms