Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL22Q53GT1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL22Q53GT1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms