Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF394Q53GI3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF394Q53GI3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF394Q53GI3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF394Q53GI3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF394Q53GI3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF394Q53GI3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF394Q53GI3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms