Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC39A12Q504Y0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC39A12Q504Y0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC39A12Q504Y0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC39A12Q504Y0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC39A12Q504Y0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC39A12Q504Y0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC39A12Q504Y0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC39A12Q504Y0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC39A12Q504Y0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC39A12Q504Y0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC39A12Q504Y0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC39A12Q504Y0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC39A12Q504Y0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC39A12Q504Y0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC39A12Q504Y0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC39A12Q504Y0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC39A12Q504Y0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC39A12Q504Y0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC39A12Q504Y0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC39A12Q504Y0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC39A12Q504Y0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms