Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAL1Q4LDG9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAL1Q4LDG9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAL1Q4LDG9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAL1Q4LDG9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAL1Q4LDG9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAL1Q4LDG9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAL1Q4LDG9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAL1Q4LDG9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAL1Q4LDG9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAL1Q4LDG9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAL1Q4LDG9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAL1Q4LDG9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAL1Q4LDG9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAL1Q4LDG9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms