Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q499Y3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Q499Y3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q499Y3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q499Y3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q499Y3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q499Y3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q499Y3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q499Y3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q499Y3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q499Y3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q499Y3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q499Y3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q499Y3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q499Y3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q499Y3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q499Y3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q499Y3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q499Y3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q499Y3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q499Y3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q499Y3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q499Y3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q499Y3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q499Y3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q499Y3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q499Y3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q499Y3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q499Y3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q499Y3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q499Y3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q499Y3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q499Y3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q499Y3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q499Y3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q499Y3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q499Y3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q499Y3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q499Y3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q499Y3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q499Y3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q499Y3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q499Y3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q499Y3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q499Y3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q499Y3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q499Y3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q499Y3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q499Y3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q499Y3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q499Y3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q499Y3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q499Y3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q499Y3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q499Y3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q499Y3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q499Y3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q499Y3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q499Y3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Q499Y3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q499Y3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q499Y3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Q499Y3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q499Y3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q499Y3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q499Y3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q499Y3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q499Y3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q499Y3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q499Y3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q499Y3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q499Y3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q499Y3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q499Y3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q499Y3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q499Y3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q499Y3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q499Y3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q499Y3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q499Y3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q499Y3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q499Y3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q499Y3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q499Y3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q499Y3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q499Y3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q499Y3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q499Y3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q499Y3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q499Y3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q499Y3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q499Y3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q499Y3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q499Y3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q499Y3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q499Y3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q499Y3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q499Y3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q499Y3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q499Y3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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