Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF212Q495C1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RNF212Q495C1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RNF212Q495C1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RNF212Q495C1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms