Protein–RNA interactions for Protein: Q494U1

PLEKHN1, Pleckstrin homology domain-containing family N member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHN1Q494U1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHN1Q494U1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLEKHN1Q494U1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLEKHN1Q494U1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLEKHN1Q494U1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms