Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP25-1Q3LHN0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms