Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF6Q330K2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFAF6Q330K2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF6Q330K2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms