Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ISXQ2M1V0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ISXQ2M1V0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ISXQ2M1V0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms