Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIST2H2ACQ16777 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST2H2ACQ16777 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST2H2ACQ16777 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST2H2ACQ16777 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST2H2ACQ16777 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST2H2ACQ16777 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms