Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK2Q16620 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK2Q16620 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK2Q16620 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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