Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NREPQ16612 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NREPQ16612 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NREPQ16612 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NREPQ16612 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NREPQ16612 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NREPQ16612 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NREPQ16612 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NREPQ16612 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NREPQ16612 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NREPQ16612 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NREPQ16612 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NREPQ16612 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NREPQ16612 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NREPQ16612 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NREPQ16612 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NREPQ16612 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NREPQ16612 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NREPQ16612 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NREPQ16612 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NREPQ16612 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NREPQ16612 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NREPQ16612 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NREPQ16612 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NREPQ16612 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NREPQ16612 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NREPQ16612 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NREPQ16612 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NREPQ16612 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NREPQ16612 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NREPQ16612 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NREPQ16612 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NREPQ16612 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NREPQ16612 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NREPQ16612 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NREPQ16612 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NREPQ16612 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NREPQ16612 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NREPQ16612 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NREPQ16612 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NREPQ16612 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NREPQ16612 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NREPQ16612 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NREPQ16612 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NREPQ16612 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NREPQ16612 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NREPQ16612 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NREPQ16612 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NREPQ16612 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NREPQ16612 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NREPQ16612 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NREPQ16612 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NREPQ16612 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NREPQ16612 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NREPQ16612 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NREPQ16612 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NREPQ16612 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NREPQ16612 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NREPQ16612 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NREPQ16612 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NREPQ16612 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NREPQ16612 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NREPQ16612 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NREPQ16612 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NREPQ16612 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NREPQ16612 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NREPQ16612 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NREPQ16612 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NREPQ16612 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NREPQ16612 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NREPQ16612 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NREPQ16612 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NREPQ16612 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NREPQ16612 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NREPQ16612 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NREPQ16612 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NREPQ16612 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NREPQ16612 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NREPQ16612 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NREPQ16612 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NREPQ16612 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NREPQ16612 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NREPQ16612 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NREPQ16612 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NREPQ16612 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NREPQ16612 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NREPQ16612 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NREPQ16612 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NREPQ16612 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NREPQ16612 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NREPQ16612 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NREPQ16612 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NREPQ16612 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NREPQ16612 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NREPQ16612 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NREPQ16612 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NREPQ16612 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NREPQ16612 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NREPQ16612 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NREPQ16612 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms