Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCBQ16585 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGCBQ16585 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms