Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXT1Q16394 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXT1Q16394 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXT1Q16394 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms