Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LAMA4Q16363 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMA4Q16363 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMA4Q16363 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMA4Q16363 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms