Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NTRK3Q16288 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NTRK3Q16288 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NTRK3Q16288 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NTRK3Q16288 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
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