Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA3Q16281 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA3Q16281 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA3Q16281 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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